MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-9

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011722	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011722	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011722	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011722	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011722	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011722	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011722	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011722	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011722	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011722	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011722	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011722	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011722	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011722	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011722	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011722	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011722	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011722	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011722	T	6	6	752	757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011722	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011722	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011722	AGG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011722	ATTA	2	8	947	954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011722	TGG	2	6	1028	1033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011722	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011722	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011722	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011722	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011722	GGA	2	6	3964	3969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011722	TAG	2	6	6764	6769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011722	ATT	2	6	6775	6780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011722	TGC	2	6	6830	6835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011722	TAA	2	6	6863	6868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011722	GAA	2	6	6912	6917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011722	GAAAA	2	10	6928	6937	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011722	A	6	6	6934	6939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011722	T	6	6	6965	6970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011722	GAA	2	6	6981	6986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011722	A	6	6	7037	7042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011722	AC	3	6	7061	7066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011722	TGT	2	6	7070	7075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011722	TTA	2	6	7078	7083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011722	GAT	2	6	7104	7109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011722	TAA	2	6	7136	7141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011722	T	7	7	7160	7166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011722	AGAA	2	8	7229	7236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011722	GCTG	2	8	7343	7350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011722	TTG	2	6	7360	7365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011722	CTT	2	6	7416	7421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011722	AAG	2	6	7456	7461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011722	TA	3	6	7509	7514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011722	A	6	6	7514	7519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011722	ATT	2	6	7527	7532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011722	TTA	2	6	7537	7542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011722	CTGCA	2	10	7582	7591	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_011722	ATT	2	6	7668	7673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011722	TAC	2	6	7781	7786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011722	TTA	2	6	8281	8286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011722	ATTT	2	8	8508	8515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011722	TTA	2	6	8517	8522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011722	TTG	2	6	8534	8539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011722	AAT	2	6	8541	8546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011722	A	6	6	8589	8594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011722	TGAG	2	8	8612	8619	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011722	AAT	2	6	8626	8631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011722	TTG	2	6	8642	8647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011722	TCA	2	6	8701	8706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011722	TAGAAT	2	12	11946	11957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011722	GAAT	2	8	11981	11988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011722	AAG	2	6	12017	12022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011722	AAG	2	6	12098	12103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011722	CA	3	6	12142	12147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011722	A	6	6	12147	12152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011722	TCAA	2	8	12204	12211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011722	TA	3	6	12265	12270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011722	AATCT	2	10	12298	12307	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011722	AAT	2	6	12334	12339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011722	AAC	2	6	12357	12362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011722	CA	3	6	12423	12428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011722	AGG	2	6	12429	12434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011722	ATTA	2	8	12478	12485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011722	TAAT	2	8	12529	12536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011722	ACAGAA	2	12	13805	13816	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_011722	AT	3	6	13900	13905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011722	TATC	2	8	13929	13936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011722	TGA	2	6	14017	14022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011722	TAC	2	6	14072	14077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011722	TAA	2	6	14116	14121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011722	AAAC	2	8	14122	14129	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011722	TAC	2	6	14132	14137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011722	A	7	7	14174	14180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011722	AAG	2	6	14197	14202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011722	A	6	6	14221	14226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011722	ATT	2	6	14290	14295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011722	TAA	2	6	14319	14324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011722	AAC	2	6	14353	14358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011722	AGG	2	6	14361	14366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011722	TGA	2	6	14376	14381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011722	TGA	2	6	14400	14405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011722	AGA	2	6	14406	14411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011722	TGA	2	6	14475	14480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011722	GAA	2	6	14599	14604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011722	ATTA	2	8	14658	14665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011722	CTA	2	6	14675	14680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011722	ATC	2	6	14730	14735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011722	ATG	2	6	14753	14758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011722	TCT	2	6	14773	14778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011722	A	6	6	14789	14794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011722	AAC	2	6	14807	14812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011722	GAA	2	6	14843	14848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011722	TAA	2	6	14922	14927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011722	T	6	6	14939	14944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011722	TAG	2	6	15100	15105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011722	ATA	2	6	16564	16569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011722	CTA	2	6	17145	17150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011722	ATA	2	6	17176	17181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011722	TAA	2	6	17205	17210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011722	TAA	3	9	17227	17235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011722	A	7	7	17234	17240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011722	TGC	2	6	17724	17729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011722	TAT	2	6	17849	17854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011722	T	6	6	17869	17874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011722	ATC	2	6	17958	17963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011722	ATT	2	6	17967	17972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011722	T	6	6	17999	18004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011722	AAT	2	6	18006	18011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011722	TAT	2	6	18020	18025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011722	TGT	2	6	18030	18035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011722	CTT	2	6	18071	18076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011722	TAA	3	9	18088	18096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011722	T	8	8	18105	18112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011722	AAT	2	6	18144	18149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011722	ATT	2	6	18150	18155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011722	T	6	6	18191	18196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011722	TTGT	2	8	18222	18229	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011722	ATT	2	6	18255	18260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011722	TGC	2	6	18270	18275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011722	CAA	2	6	18350	18355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011722	CT	3	6	18438	18443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011722	TAA	2	6	18476	18481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011722	TCT	2	6	18571	18576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011722	TTC	2	6	18643	18648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011722	AATTT	2	10	18673	18682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011722	ATT	3	9	18705	18713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011722	TCC	2	6	18737	18742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_011722	TAA	2	6	18755	18760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011722	TA	3	6	18768	18773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011722	CTT	2	6	18794	18799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_011722	A	6	6	18803	18808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011722	A	6	6	18903	18908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011722	TAC	2	6	18920	18925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_011722	GTA	2	6	18933	18938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011722	TAA	2	6	19011	19016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011722	T	7	7	19030	19036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011722	AAATA	2	10	21522	21531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011722	TAA	2	6	22574	22579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011722	TA	3	6	22585	22590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011722	T	6	6	22615	22620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011722	TTTTA	2	10	22644	22653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011722	AAT	2	6	22664	22669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011722	AAAT	2	8	22717	22724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011722	TAA	2	6	22769	22774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011722	TATT	2	8	22781	22788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011722	ATA	2	6	22789	22794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011722	AAT	2	6	22818	22823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011722	ATATGT	2	12	22835	22846	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_011722	A	7	7	22853	22859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_011722	A	7	7	22872	22878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_011722	T	7	7	22938	22944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_011722	A	6	6	22959	22964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_011722	A	7	7	24367	24373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_011722	AGG	2	6	24386	24391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_011722	ATTA	2	8	24392	24399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_011722	AT	3	6	25820	25825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011722	AATTT	2	10	25840	25849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_011722	GA	3	6	25895	25900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
184	NC_011722	TA	3	6	25967	25972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_011722	ATT	2	6	25995	26000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_011722	TGT	2	6	26004	26009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_011722	GA	3	6	26614	26619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_011722	TAG	2	6	27698	27703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_011722	T	7	7	27723	27729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_011722	A	6	6	27782	27787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_011722	TTTA	2	8	27815	27822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_011722	TA	3	6	27821	27826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_011722	CTAT	2	8	27827	27834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
194	NC_011722	TA	3	6	28363	28368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_011722	GTT	2	6	28374	28379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
196	NC_011722	A	7	7	28429	28435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.